Entity Framework 6 からFHIR のデータに連携

こんにちは！ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。

Entity Framework はobject-relational mapping フレームワークで、データをオブジェクトとして扱うために使われます。Visual Studio のADO.NET Entity Data Model ウィザードを実行するとEntity Model を作成できますが、このモデルファーストアプローチでは、データソースに変更があった場合やエンティティ操作をより制御したい場合は不都合があります。この記事では、CData ADO.NET Provider を使いコードファーストアプローチでFHIR にアクセスします。

1. Visual Studio を起動し、新しいWindows Form アプリケーションを作成します。ここでは、.NET 4.5 のC# プロジェクトを使います。
2. Visual Studio の ［パッケージ マネージャー コンソール］から'Install-Package EntityFramework' コマンドを実行し、最新のEntity Framework をインストールします。
3. プロジェクトのApp.config ファイルを修正して、FHIR Entity Framework 6 アセンブリおよびコネクションストリングへの参照を追加します。

   URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。

   汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。

   Service Base URL のサンプル

   • 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
   • Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
   • AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
   • Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/

   汎用FHIR インスタンス

   CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。

   <configuration> ... <connectionStrings> <add name="FHIRContext" connectionString="Offline=False;URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;" providerName="System.Data.CData.FHIR" /> </connectionStrings> <entityFramework> <providers> ... <provider invariantName="System.Data.CData.FHIR" type="System.Data.CData.FHIR.FHIRProviderServices, System.Data.CData.FHIR.Entities.EF6" /> </providers> <entityFramework> </configuration> </code>
4. インストールディレクトリの［lib］ > 4.0 サブフォルダにあるSystem.Data.CData.FHIR.Entities.EF6.dll を設定し、プロジェクトを作成してEntity Framework 6 を使うためのセットアップを完了します。
5. この時点でプロジェクトを作成し、すべてが正しく動作していることを確認してください。これで、Entity Framework を使ってコーディングを開始できます。
6. プロジェクトに新しい.cs ファイルを追加し、そこにクラスを追加します。これがデータベースのコンテキストとなり、DbContext クラスを拡張します。この例では、クラス名はFHIRContext です。以下のサンプルコードは、OnModelCreating メソッドをオーバーライドして次の変更を加えます：
   • PluralizingTableNameConvention をModelBuilder Conventions から削除。
   • MigrationHistory テーブルへのリクエストを削除。
   using System.Data.Entity; using System.Data.Entity.Infrastructure; using System.Data.Entity.ModelConfiguration.Conventions; class FHIRContext :DbContext { public FHIRContext() { } protected override void OnModelCreating(DbModelBuilder modelBuilder) { // To remove the requests to the Migration History table Database.SetInitializer<FHIRContext>(null); // To remove the plural names modelBuilder.Conventions.Remove<PluralizingTableNameConvention>(); } }
7. もう一つ.cs ファイルを作成し、ファイル名を呼び出そうとしているFHIR のエンティティ、例えばPatient にします。このファイルでは、エンティティとエンティティ設定の両方を定義します。以下に例を示します。 using System.Data.Entity.ModelConfiguration; using System.ComponentModel.DataAnnotations.Schema; public class Patient { [DatabaseGeneratedAttribute(DatabaseGeneratedOption.Identity)] public System.String Id { get; set; } public System.String Id { get; set; } } public class PatientMap :EntityTypeConfiguration<Patient> { public PatientMap() { this.ToTable("Patient"); this.HasKey(Patient => Patient.Id); this.Property(Patient => Patient.Id); } }
8. エンティティの作成が済んだので、コンテキストクラスにエンティティを追加します： public DbSet<Patient> Patient { set; get; }
9. コンテキストとエンティティの作成が完了したら、別クラスでデータをクエリできます。例： FHIRContext context = new FHIRContext(); context.Configuration.UseDatabaseNullSemantics = true; var query = from line in context.Patient select line;