各製品の資料を入手。
詳細はこちら →
製品をチェック
Denodo Platform でFHIR のデータソースを作成
CData JDBC ドライバを使ってDenodo Virtual DataPort Administrator でFHIR のデータ の仮想データソースを作成します。
最終更新日：2022-02-28
この記事で実現できるFHIR 連携のシナリオ
こんにちは！テクニカルディレクターの桑島です。
Denodo Platform は、エンタープライズデータベースのデータを一元管理するデータ仮想化製品です。CData JDBC Driver for FHIR と組み合わせると、Denodo ユーザーはリアルタイムFHIR のデータと他のエンタープライズデータソースを連携できるようになります。この記事では、Denodo Virtual DataPort Administrator でFHIR の仮想データソースを作成する手順を紹介します。
最適化されたデータ処理が組み込まれたCData JDBC Driver は、リアルタイムFHIR のデータを扱う上で比類のないパフォーマンスを提供します。FHIR にSQL クエリを発行すると、ドライバーはフィルタや集計などのサポートされているSQL 操作をFHIR に直接渡し、サポートされていない操作（主にSQL 関数とJOIN 操作）は組み込みSQL エンジンを利用してクライアント側で処理します。組み込みの動的メタデータクエリを使用すると、ネイティブデータ型を使ってFHIR のデータを操作および分析できます。
FHIR Virtual Port を作成
Denodo からリアルタイムFHIR のデータに接続するには、JDBC Driver のJAR ファイルをDenodo の外部ライブラリディレクトリにコピーし、Virtual DataPort Administration Tool から新しいJDBC データソースを作成する必要があります。
- CData JDBC Driver for FHIR インストーラーをダウンロードしてパッケージを展開し、JAR ファイルを実行してドライバーをインストールします。
- JAR ファイル（およびライセンスファイルがある場合はそれも）をインストール先（通常はC:\Program Files\CData\CData JDBC Driver for FHIR\lib\）からDenodo 外部ライブラリディレクトリ（C:\Denodo\Denodo Platform\lib-external\jdbc-drivers\cdata-fhir-19）にコピーします。
- Denodo Virtual DataPort Administration Tool を開き、Server Explorer タブに移動します。
- 「admin」を右クリックし、「New」->「Data source」->「JDBC」を選択します。
- JCBC Connection を設定します。
- Name：任意の名前（例：fhir）
- Database adapter：Generic
- Driver class path：C:\Denodo\Denodo Platform\lib-external\jdbc-drivers\cdata-fhir-19
- Driver class：cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
Database URI：必要な接続プロパティを使用してJDBC のURL に設定。例えば次のようになります。
jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;
Database URI の作成については以下を参照してください。
組み込みの接続文字列デザイナー
JDBC URL の作成の補助として、FHIR JDBC Driver に組み込まれている接続文字列デザイナーが使用できます。JAR ファイルをダブルクリックするか、コマンドラインからjar ファイルを実行します。
java -jar cdata.jdbc.fhir.jar接続プロパティを入力し、接続文字列をクリップボードにコピーします。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
- Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
- 「接続テスト」をクリックして設定を確認し、「保存」をクリックします。
Virtual DataPort Administration Tool でFHIR のデータを表示
データソースを作成したら、Denodo Platform で使用するFHIR のデータの基本ビューを作成できます。
- 新しく作成したVirtualPort（admin.FHIR）で「Create base view」をクリックします。
- オブジェクトツリーを展開し、インポートしたいオブジェクト（テーブル）を選択します。
- 「Create selected」をクリックしてFHIR のデータのビューを作成します。
オプション：「Create associations from foreign keys」をクリックして、オブジェクト間の関係を定義します。 - ビューを作成した状態で、Server Explorer のテーブル（cdata_fhir_patient）に移動し、選択したテーブルをダブルクリックします。
- 新しいタブで「Execution panel」をクリックしてクエリパネルを開きます。
- 「Execute」タブでクエリをカスタマイズするか、デフォルトを使用します。
SELECT * FROM cdata_fhir_patient CONTEXT ('i18n'='us_est', 'cache_wait_for_load'='true')
- 「Execute」をクリックすると、データが表示されます。
基本ビューを作成すると、Denodo Platform の他のデータソースと同様にリアルタイムFHIR のデータを操作できるようになります。例えば、Denodo Data Catalog でFHIR にクエリを実行できます。
CData JDBC Driver for FHIR の30日の無償評価版をダウンロードして、Denodo Platform でリアルタイムFHIR のデータの操作をはじめましょう！ご不明な点があれば、サポートチームにお問い合わせください。
関連コンテンツ
