各製品の資料を入手。
詳細はこちら →FHIR のデータをBoomi AtomSphere で連携利用する方法:CData JDBC Driver
CData JDBC ドライバを使って、データ統合サービス(iPaaS)のBoomi で FHIR のデータ をノーコードで連携。
最終更新日:2022-05-18
この記事で実現できるFHIR 連携のシナリオ
こんにちは!テクニカルディレクターの桑島です。
Boomi AtomSphere https://boomi.com/は、Boomi 社が提供する、 シングルインスタンス、マルチテナントアーキテクチャを特徴としているデータ統合サービス(iPaaS)です。データ統合機能だけでなく、マスターデータのハブ機能、EDI、APIManagement、WorkFlow といったビジネスユースに必要なデータ連携のすべてを実現する機能をシングルプラットフォームで提供しています。
この記事では、Boomi AtomSphere のオンプレミスAtom deployment 機能を使って、CData JDBC ドライバ経由でFHIR のデータにアクセスする方法を紹介します。CData Drivers を使うことで、RDB のようにBoomi 内でFHIR のデータを扱うことができるようになります。
Boomi のon-Premise Atom depleyment の作成
on-Premise Atom deployment (右上の青部分)を利用する構成としました。この機能を利用することでOn-Premise 側に配置したCData JDBC ドライバ経由でのSaaS 連携を実現します。
- ブラウザからBoomi Atom のManage > Atom Management のタブを開きます。
- +New > Atom を開きます。
- Atom Setup ダイアログが開くので、ブラウザを開いているマシンのOS(本例ではWindows10Pro 64bit)のSetup ファイルをダウンロードします。
- ダウンロードした「atom_install64.exe」を実行するとインストーラが起動します。
- Setup Wizard を進めます。
- ブラウザからBoomi Atom へのログインする時のUser・Password をセットして、Atom Name はデフォルトのまま、次に進みます。
- on-Premise Atom deployment のインストールディレクトリ(デフォルト)を指定して次に進みます。
- Setup Wizard を終了(Finish)します。
- ブラウザからBoomi Atom のManage > Atom Management のタブを開いて、上記で作成したon-Premise Atom Deployment が起動していることを確認します。なお、Windows マシンの場合、サービスからも起動を確認できます。on-Premise Atom deployment の作成は以上です。


Boomi on-Premise Atom deployment モジュールへのJDBC ドライバの配置
次に別途ダウンロード・インストールしたCData JDBC Driver for FHIR をBoomi on-premise Atom モジュールに配置していきます。
- JDBC Drivers ファイルをCData 製品のインストールフォルダからon-Premise Atom deployment インストールパス配下のパスにコピーします。
- cdata.jdbc.fhir.jar
- cdata.jdbc.fhir.lic (試用版では.lic ファイルは不要)
- コピー元:C:\Program Files\CData\CData JDBC Driver for FHIR 2019J\lib
- コピー先:C:\Boomi AtomSphere\Atom - 10.211.55.9\lib
コピーしたらBoomi Atom をブラウザからリスタート(Restart Atom)してください。作成したon-Premise Atom deployment のInstalledLibraries にJDBCの.jar ファイルが表示されれば成功です。

FHIR のConnectionの作成
Boomi Atom からFHIR のデータソースに接続するためのConnection を作成します。
- Welcom 画面の「Component > Connetion」を選択するとCreate Component ウィザードが開きます。
- FHIR への接続用のConnection 設定として以下の値をセットします。
- Type: Connection
- Component Name: ConnectionCDataFHIR
- Folder: 任意のパス
- Connector: Database
- そしてJDBC Driver の接続設定を行います。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用:http://my_fhir_server/r4b/
- Azure:https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS:https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google:https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います(OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください)。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
- Driver Type: Custom
- Class Name: cdata.jdbc.fhir.FHIRDriver
- User Name: 本来であれば不要ですが、空のままだと後の手順でバリデーションエラーが発生するので適当な値をセットします
- Password: 本来であれば不要ですが、空のままだと後の手順でバリデーションエラーが発生するので適当な値をセットします
- Connection URL: jdbc:fhir:URL=http://test.fhir.org/r4b/;ConnectionType=Generic;ContentType=JSON;AuthScheme=None;
- Connection の値を設定したら接続テストを行います。右上のTest Connection ボタンをクリックします。実行するAtom を選択する画面が表示されるので、上記手順で作成したon-Premise Atom deployment を選択します。
- テスト接続が成功することを確認してFinish ボタンでウィザードを閉じます。
- 作成した FHIR のデータ への接続Connection を保存(Save)します。


Boomi Atom でのFHIR のデータ Profile の作成
次にProfile を設定していきます。ProfileとはSQL(SELECT/INSERT/UPDATE/DELETE)実行時のフィールド定義です。
- FHIR のデータ のテーブルをSELECT するProfile を作成していきます。
-
- Type: Profle
- Component Name: ProfileCDataFHIR
- Folder: 任意のパス
- Connector: Database
- 二つのパラメータに、Display Name: デフォルト, Type: Select と値をセットしたら右上のImportボタンをクリックします。
- Database Import Wizardが開くので、以下のパラメータをセットして次に進みます。
- Browse in: 上記手順で作成したon-Premise Atom deployment
- Connection: 上記手順で作成した接続Connection
- FHIR のデータ 内のオブジェクトがテーブル一覧として表示されます。取得するテーブルにチェックをオンにして次に進みます。
- テーブル内のカラム一覧が表示されます。使用する項目のチェックをオンにして次に進みます。
- Import ウィザードが完了します。
- DataElements のField アイコンをクリックすると選択テーブル内のカラムが定義されていることを確認できます。また、SQL Script には取得時のSQL(SELECT)が表示されています。作成したProfile を保存します。
- これでFHIR のデータ がBoom Atom で利用できるProfile として登録されました。






Boomi AtomSphere でのFHIR のデータ の利用
あとは、設定されたProfile はRDB と同じようにBoomi Atom 内で利用することができます。カラムにマッピングを行うこともできます。

このようにCData JDBC ドライバをアップロードすることで、簡単にBoomi AtomSphere でFHIR のデータ データをノーコードで連携し、使うことが可能です。
是非、CData JDBC Driver for FHIR 30日の無償評価版 をダウンロードして、お試しください。