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PHP でMySQL からFHIR のデータにアクセス
PHP から標準MySQL ライブラリを介してFHIR に接続。
最終更新日：2022-07-18
こんにちは！ドライバー周りのヘルプドキュメントを担当している古川です。
CData SQL Gateway とODBC Driver for FHIR を使用することで、ETL を実行したりデータをキャッシュしたりすることなく、MySQL クライアントからFHIR にアクセスできます。以下のステップに従って、PHP の標準MySQL インターフェースであるmysqli とPDO_MySQL を介してFHIR のデータにリアルタイムで接続します。
CData ODBC ドライバとは？
CData ODBC ドライバは、以下のような特徴を持ったリアルタイムデータ連携ソリューションです。
- FHIR をはじめとする、CRM、MA、会計ツールなど多様なカテゴリの270種類以上のSaaS / オンプレミスデータソースに対応
- 多様なアプリケーション、ツールにFHIR のデータを連携
- ノーコードでの手軽な接続設定
- 標準 SQL での柔軟なデータ読み込み・書き込み
CData ODBC ドライバでは、1.データソースとしてFHIR の接続を設定、2.MySQL 側でODBC Driver との接続を設定、という2つのステップだけでデータソースに接続できます。以下に具体的な設定手順を説明します。
CData ODBC ドライバのインストールとFHIR への接続設定
まずは、本記事右側のサイドバーからFHIR ODBC Driver の無償トライアルをダウンロード・インストールしてください。30日間無償で、製品版の全機能が使用できます。
必要な接続プロパティの値が未入力の場合には、データソース名（DSN）で入力します。組み込みのMicrosoft ODBC Data Source Administrator を使用し、DSN を構成できます。ドライバーのインストールの最後にアドミニストレーターが開きます。Microsoft ODBC データソースアドミニストレーターを使ってDSN を作成および設定する方法は、ヘルプドキュメントの「はじめに」を参照してください。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用：http://my_fhir_server/r4b/
- Azure：https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS：https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google：https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います（OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください）。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
SQL Gateway を構成する
FHIR のデータへの接続を、仮想MySQL データベースとして設定する方法については、「SQL Gateway Overview」を参照してください。クライアントからのMySQL リクエストをリッスンするMySQL リモートサービスを構成します。このサービスはSQL Gateway UI で設定できます。
PHP から接続する
以下の例は、オブジェクト指向インターフェースを使用してクエリを接続および実行する方法を示します。 以下のパラメータを使用して接続オブジェクトを初期化し、仮想MySQL データベースに接続します。
- Host：サービスが実行されているリモートホストの場所を指定します。この例では、サービスがローカルマシンで実行されているため、"localhost" をリモートホスト設定に使用します。
- Username：SQL Gateway の「ユーザー」タブで認証したユーザーのユーザー名を指定します。
- Password：認証されたユーザーアカウントのパスワードを指定します。
- Database Name：データベース名としてシステムDSN を指定します。
- Port：サービスが実行されているポートを指定します。この例では3306 を指定します。
mysqli
<?php
$mysqli = new mysqli("localhost", "user", "password", "CData FHIR Sys","3306");
?>
PDO
<?php
$pdo = new PDO('mysql:host=localhost;dbname=CData FHIR Sys;port=3306', 'user', 'password');
?>
PHP からクエリする
接続が確立されると、テーブルにアクセスできます。以下のステップでは、例を説明します。
- テーブル（Patient）をクエリします。結果は、連想配列として$result オブジェクトに保存されます。
- 各行とカラムを順番に処理して、値を出力してPHP ページに表示することができます。
- 接続を閉じます。
mysqli
$result = $mysqli->query("SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'");
while($row = $result->fetch_assoc()) {
foreach ($row as $k=>$v) {
echo "$k : $v";
echo "<br />";
}
}
$mysqli->close();
PDO
$result = $pdo->query("SELECT Id, [name-use] FROM Patient WHERE [address-city] = 'New York'");
while($row = $result->fetch(PDO::FETCH_ASSOC)) {
foreach ($row as $k=>$v) {
echo "$k : $v";
echo "<br />";
}
}
$result = null;
$pdo = null;
おわりに
このようにCData ODBC ドライバと併用することで、270を超えるSaaS、NoSQL データをコーディングなしで扱うことができます。30日の無償評価版が利用できますので、ぜひ自社で使っているクラウドサービスやNoSQL と合わせて活用してみてください。
CData ODBC ドライバは日本のユーザー向けに、UI の日本語化、ドキュメントの日本語化、日本語でのテクニカルサポートを提供しています。
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