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詳細はこちら →PowerShell を使ってFHIR のデータをSQL Server にレプリケーション
FHIR をPowerShell スクリプトを記述。リアルタイムデータへの接続を使用してFHIR のデータをSQL Server にレプリケーション(複製)。
最終更新日:2023-09-26
こんにちは!ドライバー周りのヘルプドキュメントを担当している古川です。
CData ODBC Driver for FHIR は、Microsoft のビルトインODBC サポートを使用して、追加設定なしで連携を可能にします。ODBC ドライバーは、PowerShell から実際のFHIR のデータへの連携を即座に実現します。
PowerShell に組み込まれている.NET Framework Provider for ODBC を使用して、FHIR を他のデータベースに複製するなどの統合タスクを素早く自動化できます。この記事では、FHIR をSQL Server に5 行のコードで複製する方法を説明します。
PowerShell コードを記述し、FHIR のダウンロード以下の例を参照してください。
CData ODBC ドライバとは?
CData ODBC ドライバは、以下のような特徴を持ったリアルタイムデータ連携ソリューションです。
- FHIR をはじめとする、CRM、MA、会計ツールなど多様なカテゴリの270種類以上のSaaS / オンプレミスデータソースに対応
- 多様なアプリケーション、ツールにFHIR のデータを連携
- ノーコードでの手軽な接続設定
- 標準 SQL での柔軟なデータ読み込み・書き込み
CData ODBC ドライバでは、1.データソースとしてFHIR の接続を設定、2.PowerShell 側でODBC Driver との接続を設定、という2つのステップだけでデータソースに接続できます。以下に具体的な設定手順を説明します。
CData ODBC ドライバのインストールとFHIR への接続設定
まずは、本記事右側のサイドバーからFHIR ODBC Driver の無償トライアルをダウンロード・インストールしてください。30日間無償で、製品版の全機能が使用できます。
未指定の場合は、初めにODBC DSN(data source name)で接続プロパティを指定します。ドライバーのインストールの最後にアドミニストレーターが開きます。Microsoft ODBC Data Source Administrator を使用して、ODBC DSN を作成および構成できます。
URL をFHIR サーバーのService Base URL に設定します。これは接続したいFHIR サーバーでリソースが定義されているアドレスです。ConnectionType をサポートされている接続タイプに設定します。ContentType をドキュメントのフォーマットに設定します。AuthScheme をFHIR サーバーの認証要件に基づいて設定します。
汎用、Azure ベース、AWS ベース、およびGoogle ベースのFHIR サーバー実装がサポートされます。
Service Base URL のサンプル
- 汎用:http://my_fhir_server/r4b/
- Azure:https://MY_AZURE_FHIR.azurehealthcareapis.com/
- AWS:https://healthlake.REGION.amazonaws.com/datastore/DATASTORE_ID/r4/
- Google:https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/
汎用FHIR インスタンス
CData 製品はFHIR のカスタムインスタンスへの接続をサポートします。カスタムFHIR サーバーへの認証はOAuth で行います(OAuth の詳細はヘルプドキュメントを参照してください)。カスタムFHIR インスタンスに接続する前に、ConnectionType をGenericに設定する必要があります。
FHIR への接続
以下のコードは、DSN を使用してPowerShell でデータソースへの接続を初期化する方法を説明します。
$conn = New-Object System.Data.Odbc.OdbcConnection
$conn.ConnectionString = "DSN=CData FHIR Source x64"
FHIR のデータをSQL Serverにバックアップ
キャッシュを有効にした後、以下のコードを使用して、データをSQL Server に複製できます。
次の接続プロパティを設定し、キャッシュデータベースを構成します。
CacheProvider:ADO.NET プロバイダの名前です。これは、ご使用のバージョンの.NET のMachine.config にあります。例として、SQL Server を構成するにはSystem.Data.SqlClient と入力します。
CacheConnection:データベースの接続に必要なプロパティの接続文字列です。以下はSQL Server の一例です。
Server=localhost;Database=RSB;User Id=sqltest;Password=sqltest;
この例のSQL クエリを使用して、スキーマを含むキャッシュされたテーブル全体を更新できます。既存のキャッシュはすべて削除されます。
$conn.Open()
# Create and execute the SQL Query
$SQL = "CACHE DROP EXISTING SELECT * FROM " + $Patient
$cmd = New-Object System.Data.Odbc.OdbcCommand($sql,$conn)
$count = $cmd.ExecuteNonQuery()
$conn.Close()
ドライバーを使用すると、キャッシュ機能を完全に制御できます。その他のキャッシュコマンドと使用例については、ヘルプドキュメントを参照してください。他のデータベースに複製する手順についても、ヘルプドキュメントを参照してください。
その他の操作
PowerShell でFHIR を取得するには、OdbcDataAdapter メソッドのFill メソッドを呼び出します。データ操作コマンドを実行するには、OdbcCommand オブジェクトを初期化してからExecuteNonQuery を呼び出します。以下は、.NET Framework Provider for ODBC を介した、FHIR への コマンドの例です。
FHIR のデータの取得
$sql="SELECT Id, [name-use] from Patient"
$da= New-Object System.Data.Odbc.OdbcDataAdapter($sql, $conn)
$dt= New-Object System.Data.DataTable
$da.Fill($dt)
$dt.Rows | foreach {
$dt.Columns | foreach ($col in dt{
Write-Host $1[$_]
}
}
FHIR からPowerShell へのデータ連携には、ぜひCData ODBC ドライバをご利用ください
このようにCData ODBC ドライバと併用することで、270を超えるSaaS、NoSQL データをコーディングなしで扱うことができます。30日の無償評価版が利用できますので、ぜひ自社で使っているクラウドサービスやNoSQL と合わせて活用してみてください。
CData ODBC ドライバは日本のユーザー向けに、UI の日本語化、ドキュメントの日本語化、日本語でのテクニカルサポートを提供しています。