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CouchDB のデータをR で分析：JDBC での接続
CData JDBC Driver で標準的なR 関数とお好みの開発環境を使ってCouchDB を分析。
最終更新日：2023-09-21
この記事で実現できるCouchDB 連携のシナリオ
こんにちは！ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。
CData JDBC Driver for ApacheCouchDB とRJDBC package を使って、R でリモートCouchDB データ を利用できます。CData Driver を使うことで、業界が認めた基準で書かれたドライバーを活用して、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってCouchDB にSQL クエリを実行する方法、および標準R 関数を呼び出してCouchDB をビジュアライズする方法について説明します。
R をインストール
マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープン R を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードから利益を得られたドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。
RJDBC パッケージをロード
ドライバーを使うにはRJDBC パッケージをダウンロードします。RJDBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。
library(RJDBC)
JDBC データソースとしてCouchDB に接続
下記の情報を使いCouchDB にJDBC データソースとして接続します。
- Driver Class：cdata.jdbc.apachecouchdb.ApacheCouchDBDriver に設定。
- Classpath：Driver JAR の場所を設定します。デフォルトではインストールディレクトリの［lib］サブフォルダです。
dbConnect やdbSendQuery のようなDBI 関数は、R にデータアクセスコードを書くための統一インターフェースを提供します。
driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.apachecouchdb.ApacheCouchDBDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.apachecouchdb.jar", identifier.quote = "'")
これで、DBI 関数を使ってCouchDB に接続しSQL クエリを実行する準備が整いました。dbConnect 関数を使ってJDBC 接続を初期化します。一般的なJDBC 接続文字列は次のとおりです。
conn <- dbConnect(driver,"Url=http://localhost:5984;User=abc123;Password=abcdef;")
Apache CouchDB 接続プロパティの取得・設定方法
Url 接続プロパティをApache CouchDB インスタンスのURL に設定します。例：http://localhost:5984
ユーザー（またはJWT）が特定のデータベースだけにアクセスできるようにしたい場合は、Apache CouchDB インスタンスで"admin_only_all_dbs" オプションを設定し、テーブルをリストするために本製品が必要とする"/_all_dbs" エンドポイントへのアクセス権をすべてのユーザーに付与する必要があります。
Apache CouchDB への認証
3種類の認証をサポートします。- Basic：基本的なユーザー名 / パスワード認証。
- JWT：JWT 認証。
- None：パブリックなデータベースへの匿名アクセス。
Basic 認証
データに接続するには以下を設定します。
- AuthScheme：Basic。
- User：認証に使用されるApache CouchDB ユーザーアカウント。
- Password：認証するユーザーに関連付けられたApache CouchDB パスワード。
その他の認証方法は、ヘルプドキュメント の「接続の確立」セクションを参照してください。
スキーマ Discovery
ドライバーはCouchDB API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデルします。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。
dbListTables(conn)
SQL クエリの実行
dbGetQuery 関数を使ってCouchDB API がサポートするすべてのSQL クエリを実行できます：
movies <- dbGetQuery(conn,"SELECT MovieRuntime, MovieRating FROM Movies WHERE MovieRating = 'R'")
次のコマンドを使って、結果を［data viewer］ウィンドウで見ることができます。
View(movies)
CouchDB データ をプロット
CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータ初期化パッケージを使ってCouchDB を分析する準備が整いました。ビルトインバーのplot 関数を使って簡単なバーを作成できます。
par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(movies$MovieRating, main="CouchDB Movies", names.arg = movies$MovieRuntime, horiz=TRUE)
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